Eesti Meretööstuse liidu eelkäija on 1997. aastal puupaatide ehitamise traditsioonide hoidmiseks ja edasikandmiseks loodud mittetulundusühing. Eesti meretööstuse kiire areng ja ettevõtete ühised huvid tõid kaasa ühenduse esimese laienemise ja väikelaevaehituse liidu nime 2009. aastal. Nüüdseks ühendab liit Eesti meretööstuse ettevõtteid ja organisatsioone eesmärgiga edendada Eesti laeva- ja paadiehitust, avameretööstust ja nende sidussektoreid.

Liit esindab Eesti meretööstuse huve suhetes avaliku sektori ja rahvusvaheliste organisatsioonidega, koordineerib koostöö-, ühisturundus- ja mainekujundusprojekte, tegeleb valdkonnaga seotud õppekavade arendamise ja eriala populariseerimisega ning vahendab meretööstust puudutavat informatsiooni.